酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取
該試劑盒采用DNA吸附柱和du有的溶液系統,適合于從多種來源的酵母培養物中快速簡單地提取基因組DNA。約3ml處于指數生長期的酵母培養液一般一次抽提可純化出10-15μg的高質量的基因組DNA。酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取
酵母基因組DNA快速提取試劑盒(離心柱型)
酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取
目錄號:40210
目錄編號 | 包裝單位 |
40210-50 | 50次 |
40210-50-1 | 50次(帶蛋白酶K) |
40210-50-2 | 50次(帶Lyticase) |
40210-50-3 | 50次(帶蛋白酶K,帶Lyticase) |
v 適用范圍:
適用于快速提取各種酵母基因組DNA
v 試劑盒組成、儲存、穩定性:
試劑盒組成 | 保存 | 50次 |
緩沖液YB | 室溫 | 20ml |
結合液CB | 室溫 | 11ml |
抑制物去除液IR | 室溫 | 25ml |
漂洗液WB | 室溫 | 15ml |
第一次使用前按說明加指ding量乙醇 | ||
洗脫緩沖液EB | 室溫 | 15ml |
Lyticase 10U/μl | 室溫 | 2500U |
蛋白酶K fen(可選)20mg/ml | 室溫 | 20mg |
吸附柱AC | 室溫 | 50個 |
收集管(2ml) | 室溫 | 50個 |
本試劑盒在室溫儲存12個月不影響使用效果。
儲存事項:
1. 結合液CB或者抑制物去除液IR低溫時可能出現析出和沉淀,可以在37℃水浴幾分鐘幫助重新溶解,恢復澄清透明后冷卻到室溫即可使用。
2. 為避免降低活性,方便運輸,提供蛋白酶K為凍干粉狀(20mg),收到后,可短暫離心后,加入1毫升滅菌水溶解配制成20mg/ml溶液,因為反復凍融可能會降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量分裝凍存,-20℃保存。
3. 為避免降低活性,方便運輸,提供Lyticase(2500U)為凍干粉狀,收到后,可短暫離心后,加入0.25毫升滅菌水溶解配制成10U/μl,因為反復凍融可能會降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量分裝凍存,-20℃保存。
4. 避免試劑長時間暴露于空氣中產生揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用后應及時蓋緊蓋子。
v 產品介紹:
該試劑盒采用DNA吸附柱和du有的溶液系統,適合于從多種來源的酵母培養物中快速簡單地提取基因組DNA。約3ml處于指數生長期的酵母培養液一般一次抽提可純化出10-15μg的高質量的基因組DNA。純化DNA產物可直接用于PCR、酶切和雜交等實驗。酵母細胞經lyticase處理去除細胞壁后,du特的結合液/蛋白酶K迅速裂解細胞和滅活細胞內核酸酶,然后基因組DNA在高離序鹽狀態下選擇性吸附于離心柱內硅基質膜, 再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟,抑制物去除液和漂洗液將細胞代謝物,蛋白等雜質去除,最后低鹽的洗脫緩沖液將純凈基因組DNA從硅基質膜上洗脫。
v 產品特點:
1. 離心吸附柱內硅基質膜全部采用進口世界有名公司特制吸附膜,柱與柱之間吸附量差異極小,可重復性好。克服了國產試劑盒膜質量不穩定的弊端。
2. 不需要使用有毒的苯fen等試劑,也不需要乙醇沉淀等步驟。
3. 快速,簡捷,單個樣品裂解后操作一般可在30分鐘內完成。
4. 多次柱漂洗確保高純度,OD260/OD280典型的比值達1.7~1.9,可直接用于PCR,Southern-blot和各種酶切反應。
v 注意事項:
1. 所有的離心步驟均在室溫完成,使用轉速可以達到13,000rpm的傳統臺式離心機,如Eppendorf 5415C 或者類似離心機。
2. 需要自備乙醇、異丙醇、β-巰基乙chun。
3. 開始實驗前將需要的水浴先預熱到37℃和70℃備用。
4. 結合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時,要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
5. 用戶需要自備Sorbitol buffer( 1M 山梨chun,0.1M Na2EDTA,14 mMβ-巰基乙醇)。配制方法:在600 ml 去離子水里面溶解182.2克山梨chun,加入200 ml 0.5 M Na2EDTA (pH 8.0) ,不需要調節PH值,定容到1L,4℃保存。臨用前加0.1%β-巰基乙醇(商品化的β-巰基乙醇摩爾濃度一般為14M)。
6. 菌體濃度檢測一般OD600值為1的時候,釀酒酵母細胞是1-2x107 cells/ml,由于菌種和分光度計不同即使同樣細胞數量OD值變化也很大,以上僅供參考。
7. 洗脫液EB不含有螯合劑EDTA,不影響下游酶切、連接等反應。也可以使用水洗脫,但應該確保批pH大于7.5,pH過低影響洗脫效率。用水洗脫DNA應該保存在-20℃。DNA如果需要長期保存,可以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影響下游酶切反應,使用時可以適當稀釋。
v 操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)
提示:
e 第一次使用前請先在15ml漂洗液WB中加入60ml無水乙醇,充分混勻,加入后請及時在方框打鉤標記已加入乙醇,以免多次加入!
e 吸取使用量的Sorbitol buffer加入0.1%β-巰基乙醇,回復到室溫備用。
1. 取1-3毫升酵母培養物(不超過3X107cells,最好是早對數生長期),12,000rpm離心30秒,盡可能的吸棄上清,收集菌體。
收集超過1.5毫升菌液,可以離心棄上清后,在同一個1.5ml管內加入更多的菌液,重復步驟1,直到收集到足夠的菌體。
2. 加入600μl Sorbitol buffer,輕柔吹打充分重懸細胞;可按照20-50U/1x107cells的比例加入Lyticase(一般3 ml培養物可能需要加到150U),充分顛倒混勻,37℃溫育至少30分鐘消化細胞壁,中間可顛倒數次幫助消化。
如果破壁效果不好導致DNA產量低,可以加大lyicase用量來提高酶工作濃度,還可以延長消化時間來提高效果,不適合Lyticase消化的酵母可選用Zymolase或者其它方法如玻璃珠渦旋,煮沸,反復凍融等。
3. 13,000rpm離心1分鐘,盡可能吸棄上清,加180μl 緩沖液YB充分重懸細胞團。
4. 加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。
5. 將混合物放置在55℃水浴消化直到消化wan全,期間輕柔的振蕩幾次幫助裂解。
所需消化時間和酵母數量、種類和生長狀態有關,一般15分鐘即可,但是如果方便的話消化過夜也無不良影響。
可選步驟,一般不需要: 如果RNA殘留較多,需要去除RNA,可在完成操作步驟5后加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鐘。
6. 加入200μl結合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,70℃放置10分鐘。
7. 冷卻后加入100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時可能會出現絮狀沉淀。
8. 將上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一個吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液。
9. 加入500μl抑制物去除液IR,12,000rpm 離心30秒,棄廢液。
10. 加入700μl漂洗液WB(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。
11. 加入500μl漂洗液WB,12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。
12. 將吸附柱AC放回空收集管中,13,000rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液,以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應。
13. 取出吸附柱AC,放入一個干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加100μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在65-70℃水浴中預熱效果更好),室溫放置3-5分鐘,12,000rpm 離心1分鐘。將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鐘,12,000rpm離心1分鐘。
洗脫體積越大,洗脫效率越高,如果需要DNA濃度較高,可以適當減少洗脫體積,但是最小體積不應少于50μl,體積過小降低DNA洗脫效率,減少DNA產量。
14. DNA可以存放在2-8℃,如果要長時間存放,可以放置在-20℃。
v 問題與解決方法
問題 | 評論與建議 |
DNA產量低 | *某些種類酵母裂解困難-建議:仔細閱讀步驟2,確認處理的酵母種類可以用lyticase裂解,還可以考慮選用其它裂解方法如Zymolase、玻璃珠渦旋、煮沸、反復凍融等,lyticase最好按照使用量分裝凍存,保證有效性,使用早對數生長期酵母。 *蛋白酶K失效了-建議:按照每次使用量分裝凍存,避免反復凍融,延長處理時間。 *裂解不wan全或者和異丙醇沒有充分混勻-建議:加入結合液后,和加入蛋白酶K后立即吹打或者渦旋混勻;加入異丙醇后立即吹打或者渦旋混勻才加入吸附柱,如果太粘稠必須渦旋振蕩15秒充分混勻。 |
DNA降解了 | *組織中核酸酶活性導致降解-建議:樣品處理前妥善保存在-20℃,處理量不要過量。 |
未提取到DNA | *漂洗液WB中忘記加無水乙醇-建議:第一次實驗時,在漂洗液WB中加入指ding量無水乙醇。 |
洗脫下來的 | *離心柱殘留有較多乙醇或者底部不慎沾有乙醇-建議:確保做了步驟12,否則殘留乙醇會影響洗脫效率。 *使用了水或者其它非優良液體代替洗脫緩沖液-建議:仔細閱讀注意事項7和步驟13和只使用洗脫緩沖液EB洗脫。 |
A260吸光值 | *一些硅基質膜成分一起洗脫下來,干擾了吸光值-建議:將洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鐘,小心取上清使用。 |
DNA下游酶切 | *一些硅基質膜成分一起洗脫下來,抑制了酶切反應-建議:將洗脫的基因組DNA溶液13,000rpm再離心一分鐘,小心取上清使用。 *離心柱殘留有較多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反應-建議:確保做了步驟12,然后空氣中晾幾分鐘,讓殘留乙醇揮發。 |
酵母基因組DNA快速提取試劑盒 核酸提取